Цвијић је у Географском заводу изводио наставу у виду предавања, вежбања, географског семинара и научних екскурзија. Према прегледу предавања на Универзитету, која се налазе у Архиву Српске академије наука и уметности, Цвијић је од 1905. па све до 1925. године држао наставу према следећем распореду:
- Предавања за први (зимски) семестар 1906/07:
- Универзитетска власт – ректор др Јован Цвијић;
- Универзитетски савет – председник др Јован Цвијић;
- Универзитетска управа – председник др Јован Цвијић;
- Лимнологија и океанографија (3 часа недељно, понедељком, утроком и средом од 17 до 18 часова);
- Језера Балканског полуострва (1 час недељно, петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (3 часа недељно, четвртком од 15 до 18 часова);
- Картографска и антропогеографска вежбања (број часова и распоред према договору са студентима).
- Предавања за други (летњи) семестар 1906/07:
- Универзитетска власт – ректор др Јован Цвијић;
- Универзитетски савет – председник др Јован Цвијић;
- Универзитетска управа – председник др Јован Цвијић;
- Геоморфологија (3 часа недељно, понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова);
- Формирање долина Балканског полуострва (1 час недељно, петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (3 часа недељно, четвртком од 15 до 18 часова);
- Практична вежбања за почетнике (3 часа недељно, суботом од 15 до 18 часова у Географском заводу).
- Предавања за први (зимски) семестар 1907/08:
- Др Јован Цвијић редовни професор географије у одсуству.
- Предавања за други (летњи) семестар 1907/08:
- Др Јован Цвијић редовни професор географије на одсуству од 1. априла; објавиће своја предавања доцније.
- Предавања за други (летњи) семестар 1908/09:
- Основе физичке географије (4 часа недељно, понедељком, уторком, средом и петком од 17 до 18 часова, слушаоница 50);
- Географски семинар (3 часа недељно, четвртком од 15 до 18 часова);
- Картографска вежбања (број и распоред часова према договору са студентима).
- Предавања за први (зимски) семестар 1909/10:
- Морфологија Балканског полуострва и Аустроугарске (4 часа недељно, понедељком, уторком, средом и петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (3 часа недељно, четвртком од 15 до 18 часова);
- Картографска вежбања (уз помоћ асистента Т. В. Маринковића, понедељком после подне).
- Предавања за први (зимски) семестар 1910/11:
- Геоморфологија (понедељком и уторком од 17 до 18 часова);
- Географија и етнографија Старе Србије (средом и петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (четвртком од 15 до 18 часова);
- Географска вежбања (према договору са студентима, уз припомоћ асистента Милорада Драгића).
- Предавања за други (летњи) семестар 1910/11:
- Географија и етнографија Старе Србије и Македоније (понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова);
- Тектоника Балканског полуострва (петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (четвртком од 15 до 18 часова);
- Картографска вежбања (петком од 15 до 17 часова, уз припомоћ асистента Милорада Драгића).
- Предавања за први (зимски) семестар 1911/12:
- Геоморфологија Србије и суседних области (понедељком, уторком, средом и петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (четвртком од 15 до 18 часова);
- Картографска вежбања (према договору са студентима, уз припомоћ асистента Милорада Драгића).
- Предавања за први (зимски) семестар 1912/13:
- Физичка географија (понедељком, уторком, средом и петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (четвртком од 15 до 18 часова);
- Географско и картографско вежбање (суботом од 14 до 17 часова).
- Предавања за други (летњи) семестар 1913/14:
- Морфологија Земљине површине (4 часа недељно, понедељком, уторком, средом и петком од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (са Јевтом Дедијером, 2 часа недељно, четвртком од 16 до 18 часова);
- Екскурзије (према договору са студентима).
- Предавања за други (летњи) семестар 1922/23:
- Геоморфологија (3 часа недељно,понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (2 часа недељно, четвртком од 15 до 17 часова);
- Картографска вежбања (2 часа недељно, према договору са студентима).
- Предавања за први (зимски) семестар 1923/24:
- Геоморфологија (3 часа недељно, понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (2 часа недељно,четвртком од 15 до 17 часова);
- Картографска вежбања (2 часа недељно, суботом од 14 до 16 часова).
- Предавања за други (летњи) семестар 1923/24:
- Геоморфологија (3 часа недељно, понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова, слушаоница Географског завода);
- Географски семинар (2 часа недељно, четвртком од 15 до 17 часова, са Боривојем Милојевићем, слушаоница Географског завода);
- Картографска вежбања (2 часа недељно, понедељком од 14 до 16 часова);
- Екскурзије (према договору са студентима).
- Предавања за први (зимски) семестар 1924/25:
- Геоморфологија (3 часа недељно, понедељком, уторком и средом од 17 до 18 часова);
- Географски семинар (2 часа недељно, четвртком од 15 до 17 часова, са др Боривојем Милојевићем, слушаоница Географског института).
- Предавања за други (летњи) семестар 1924/25:
- Др Јован Цвијић, редовни професор овог семестра неће држати предавања.